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环状RNA测序分析案例

作者:上海英拜生物科技有限公司 2015-09-29T00:00 (访问量:4629)

 案例:以结肠癌,卵巢癌,特发性肺纤维化及正常的人组织为例探讨circular RNAs的富集与增殖的相关性

 

背景:最新研究表明,circular RNAs大量存在,是构成生物体RNA网络的一部分,而且研究者们推测circular RNAsmiRNAs一样具有生物学功能。

 

目的:利用Illumina测序平台对细胞增殖速度不同的样品(正常组织和细胞,不同肿瘤组织和细胞,非肿瘤疾病组织和细胞)的circular RNAs进行分析,探究circular RNAs的富集与细胞增殖的相关性。

 

结果:首次发现circular RNAs在组织和细胞的富集程度与细胞增殖速度呈现负相关关系,即肿瘤组织和细胞中circular RNAs表达量显著低于正常组织和细胞。

 

原文索引:

Bachmayr-Heyda, A. et al. (2015). Correlation of circular RNA abundance with proliferation--exemplified with colorectal and ovarian cancer, idiopathic lung fibrosis, and normal human tissues. Sci Rep 5, 8057.

 

1:正常结肠组织与结肠癌组织的circular RNAs表达分析

2:不同组织中circular RNAslinear RNAs 的比例

 

 

 

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